Η άσχημη μυρωδιά το πρωί οφείλεται κατά κύριο λόγο στη μειωμένη παραγωγή σάλιου (ξηροστομία), που συμβαίνει φυσιολογικά κατά τον ύπνο, το οποίο είναι απαραίτητο για να απομακρυνθούν από τη στοματική κοιλότητα τα υπολείμματα τροφής. Η ξηροστομία, συνδυασμένη με το γεγονός ότι το αίμα «λιμνάζει» κατά την ύπτια θέση του ύπνου, οδηγούν στην εξάπλωση των μικροβίων που βρίσκονται στη στοματική κοιλότητα και παράγουν ενώσεις, οι οποίες ευθύνονται για την άσχημη μυρωδιά της αναπνοής. Η ξηροστομία ωστόσο μπορεί να αποτελεί συνοδό σύμπτωμα άλλων ασθενειών όπως α) νεφρική ανεπάρκεια, β) αυτοάνοσο νόσημα (πχ σύνδρομο Sjӧgren) ή να οφείλεται στη λήψη φαρμάκων (πχ αντιαλλεργικά). Το ροχαλητό και η αναπνοή από το στόμα (αντί για τη μύτη) έχουν σαν αποτέλεσμα να ξηραίνεται περισσότερο η στοματική κοιλότητα κι έτσι η αναπνοή μυρίζει πιο άσχημα το πρωί.

Η κακοσμία μπορεί επίσης να συνδέεται με οδοντιατρικά προβλήματα, κυρίως τις περιοδοντικές παθήσεις (ουλίτιδα, περιοδοντίτιδα) λόγω συσσώρευσης των βακτηρίων.

Άλλες παθήσεις που μπορεί να συνδέονται με άσχημη μυρωδιά είναι οι αλλεργίες(σε συχνές κρίσεις), ο διαβήτης, ηπατικά προβλήματα και η γαστροοισοφαγική παλινδρόμηση.