Der schlechte Geruch am Morgen ist vor allem aufgrund der   verringerten Produktion von Speichel (Mundtrockenheit) , die normalerweise während des Schlafes auftritt, die zur Entnahme der Nahrungsreste  aus der Mundhöhle notwendig ist. Mundtrockenheit  kombiniert mit  dem  “stagnierenden” Blut während man auf dem Rücken schläft, kann  zur Ausbreitung von Bakterien in der Mundhöhle führen und Verbindungen erzeugen, die für den schlechten Atemgeruch verantwortlich sind. Wenn der Mund trocken ist, kann das ein Symptom für andere Krankheiten sein a) Niereninsuffizienz b) Autoimmunkrankheit (z.B. Sjӧgren Syndrom) oder aufgrund von Medikamenten (z.B. Allergien).
Schnarchen und Atem aus dem Mund und nicht der Nase hat als  Ergebnis, dass die Mundhöhle getrocknet wird und dass der Atem  schlecht am Morgen riecht.

Der Geruch kann auch mit anderen Problemen verbunden sein wie zum Beispiel Parodontitis (Gingivitis, Parodontitis) aufgrund der Ansammlung von Bakterien.

Andere Krankheiten können auch für den schlechten Geruch verantwortlich sein wie  Allergien (bei häufigen Anfällen), Diabetes, Lebererkrankungen und Refluxkrankheit.